Ученые из Стэнфордского университета создали искусственный микробиом, состоящий из 124 видов бактерий. Эту среду ученые окрестили «Ноевым ковчегом», она имитирует естественный симбиоз полезных бактерий в кишечнике.
Каждый член микробиома несет определенную функцию. Сложность в создании искусственной колонии состояла в том, чтобы воспроизвести условия, когда ни один вид не подавлял бы другой. При этом они должны выполнять все те же функции, что и в естественной среде кишечника.
Определить, пропускать или нет бактерию на «борт ковчега», было непросто — состав микробиома каждого человека уникален. Чтобы решить эту проблему, ученые секвенировали микробные гены более чем трех сотен взрослых людей.
Для синтетической колонии исследователи выбрали 104 бактериальных штамма, которые находят не менее чем у 20% людей. Каждый вид бактерии вырастили отдельно, а затем их смешали в единую массу.
Чтобы обогатить и приблизить колонию микроорганизмов к естественной среде, исследователи использовали человеческие фекалии. В итоге при взаимодействии с экскрементами колония пополнилась еще 20 «новичками», которые заняли свою нишу.
Ученые проверили эффективность технологии на мышах. Исследование показало, что совокупность бактерий не только успешно прижилась в стерильном кишечнике, но и помогла справиться с кишечной палочкой — так же, как естественный микробиом.
Известно, что бактериальная среда кишечника влияет на нервную систему и важна при иммунотерапии рака. Поэтому для использования разработки в медицине открываются богатые возможности.
Недавно ученые назвали продукт, который убивает микробиом человека.