Скорее всего, это следы присутствия кротов, мышей и землероек
Отверстия в земле могут оставлять землеройки, мыши-полевки и кроты. Они повреждают корни растений и зреющие корнеплоды, поэтому огородники стремятся избавиться от нежелательных землекопов. Для этого применяют различные средства, включая механические ловушки, отраву и различные отпугиватели. Свой вклад в избавление огорода от мышей, землероек и кротов могут вносить домашние кошки.
Если отверстия в земле имеют небольшой диаметр, то их, вероятно, оставила медведка — крупное насекомое из отряда прямокрылых, которое также вредит посевам.