Потому что разряд случается между облаками
Разные части грозовых облаков могут нести противоположные электрические заряды, а точнее, иметь разный электрический потенциал. В итоге примерно 75% грозовых разрядов происходит между грозовыми облаками или даже между частями одного облака.